حل تشخيص TB و DR -TB الرائد بواسطة #MACRO & MICRO -Test!

سلاح جديد لتشخيص مرض السل واكتشاف مقاومة الأدوية: جيل جديد يستهدف التسلسل (TNGs) جنبا إلى جنب مع التعلم الآلي لتشخيص مرض السل فرط الحساسية

تقرير الأدب: CCA: نموذج تشخيص يعتمد على TNGs والتعلم الآلي ، وهو مناسب للأشخاص الذين يعانون من مرض السل البكتيري والتهاب السحايا السل.

عنوان الأطروحة: تسلسل الجيل التالي من الجيل التالي والتعلم الآلي: استراتيجية تشخيصية حساسة للغاية للأنابيب الرئوية الرئوية والتهاب السحايا الأنبوبي.

الدورية: 《Clinica Chimica Acta》

إذا ： 6.5

تاريخ النشر: يناير 2024

جنبا إلى جنب مع جامعة أكاديمية العلوم الصينية ومستشفى بكين الصدر بجامعة كابيتال ميديون وفرت حساسية الكشف عن مرض السل مع القليل من البكتيريا والتهاب السحايا السل ، طريقة تشخيص فرط الحساسية الجديدة للتشخيص السريري لنوعين من السل ، وساعدت على التشخيص الدقيق ، والكشف عن مقاومة الأدوية وعلاج السل. في الوقت نفسه ، وجد أن CFDNA البلازما للمريض يمكن استخدامه كنوع عينة مناسب لأخذ العينات السريرية في تشخيص TBM.

في هذه الدراسة ، تم استخدام 227 عينة من البلازما وعينات السوائل النخاعية لإنشاء مجموعات سريرية ، حيث تم استخدام عينات الأتراب التشخيصية المختبرية لتحديد نموذج التعلم الآلي لتشخيص السل ، واستخدمت عينات الأتراب التشخيصية السريرية المنشأة نموذج التشخيص. تم استهداف جميع العينات أولاً بواسطة تجمع مسبار التقاط مستهدف مصمم خصيصًا لسل المتفطرة. بعد ذلك ، استنادًا إلى بيانات تسلسل TB-TNGS ، يتم استخدام نموذج شجرة القرار لأداء التحقق من 5 أضعاف على مجموعات التدريب والتحقق من صحة قائمة انتظار التشخيص المختبري ، ويتم الحصول على عتبات تشخيصية لعينات البلازما وعينات السوائل الدماغية. يتم إحضار العتبة التي تم الحصول عليها إلى مجموعتين اختبار من قائمة انتظار التشخيص السريري للكشف ، ويتم تقييم الأداء التشخيصي للمتعلم بواسطة منحنى ROC. أخيرًا ، تم الحصول على نموذج تشخيص السل.

الشكل 1 مخطط تخطيطي لتصميم البحث

النتائج: وفقًا للعتبات المحددة لعينة CSF DNA (AUC = 0.974) وعينة CFDNA البلازما (AUC = 0.908) المحددة في هذه الدراسة ، من بين 227 عينة ، كانت حساسية عينة CSF 97.01 ٪ ، وكانت الخصوصية 95.65 ٪ ، و كانت حساسية وخصوصية عينة البلازما 82.61 ٪ و 86.36 ٪. في تحليل 44 عينة مقترنة من CFDNA البلازما والحمض النووي السائل النخاعي من مرضى TBM ، فإن الاستراتيجية التشخيصية لهذه الدراسة لها تناسق عالٍ قدر (42/44). في الأطفال الذين يعانون من مرض السل الرئوي ، تكون الاستراتيجية التشخيصية لهذه الدراسة أكثر حساسية لعينات البلازما من نتائج اكتشاف Xpert لعينات عصير المعدة من نفس المرضى (28.57 ٪ مقابل 15.38 ٪).

الشكل 2 تحليل تحليل التشخيص السل لعينات السكان

الشكل 3 النتائج التشخيصية للعينات المقترنة

الخلاصة: تم إنشاء طريقة تشخيصية شديدة الحساسية للسل في هذه الدراسة ، والتي يمكن أن توفر أداة تشخيصية بأعلى حساسية للكشف للمرضى السريريين الذين يعانون من مرض السل القلة (الثقافة السلبية). قد يكون الكشف عن مرض السل شديد الحساسية استنادًا إلى البلازما CFDNA نوعًا مناسبًا للعينة لتشخيص مرض السل النشط والتهاب السحايا السل (من السهل جمع عينات البلازما من السائل الدماغي للمرضى المشتبه بهم في الدماغ).

الرابط الأصلي: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990؟ عبر ٪ 3dihub

مقدمة موجزة لمنتجات الكشف عن سلسلة مرض السل الكلي والاختبار

في ضوء حالة العينة المعقدة لمرضى السل والاحتياجات المختلفة ، يوفر الاختبار الكلي والميكرو مجموعة كاملة من حلول NGS لاستخراج التهوية من عينات البلغم ، وبناء مكتبة Qualcomm وتسلسلها ، وتحليل البيانات. تغطي المنتجات التشخيص السريع لمرضى مرض السل ، والكشف عن مقاومة المخدرات من مرض السل ، وكتابة مرض السل الفطري و NTM ، وفرط الحساسية من مرض السل السلبي للبكتيريا والأشخاص السل ، وما إلى ذلك.

مجموعات الكشف التسلسلي للسل والبكتيريا المتفطرة:

البند لا	اسم المنتج	محتوى اختبار المنتج	نوع العينة	نموذج قابل للتطبيق
HWTS-3012	عامل إطلاق العينة	تم استخدامه في معالجة التقييم لعينات البلغم ، وقد حصل على رقم سجل من الدرجة الأولى ، وهو Sutong Machinery Equipment 20230047.	البلغم
HWTS-NGS-P00021	مجموعة الكشف عن كمية Qualcomm للاختراف شديد الحساسية (طريقة التقاط التحقيق)	الكشف عن فرط الحساسية غير الغازي (الخزعة السائلة) لسل السلبية السلبية وعقيدات الدماغ ؛ تم تحليل عينات من الأشخاص المشتبه في إصابتها بالسل أو عدم البكتيريا غير المتسللة عن طريق الفطريات المتسلسلة العالية ، ومعلومات الكشف عن ما إذا كان السل أو عدم التسلل المتفوق في السلوكيوم الأول من السل. تم توفيرها.	الدم المحيطي ، سائل الغسل السنخية ، المائي ، استسقاء ، عينة ثقب التركيز ، السائل النخاعي.	الجيل الثاني
HWTS-NGS-T001	مجموعة طباعة الفطريات وكشف مقاومة الأدوية (طريقة تسلسل تضخيم مضاعفة)	اختبار كتابة Mycobacterium ، بما في ذلك MTBC و 187 NTM；يغطي الكشف عن مقاومة المخدرات من مرض السل المتفطرة 13 مخدرات و 16 مواقع طفرة أساسية لجينات مقاومة الأدوية.	البلغم ، سائل الغسل السنخية ، المائية والاستسقاء ، عينة ثقب التركيز ، السائل النخاعي.	الجيل الثاني/الثالث منصة مزدوجة

أبرز الأحداث: مجموعة HWTS-NGS-T001 طباعة الفطريات واكتشاف مقاومة الأدوية (طريقة تضخيم مضاعفة)

مقدمة المنتج

يعتمد المنتج على أدوية الخط الأول والثاني الرئيسي الموصوف في إرشادات علاج السل منظمة الصحة العالمية ، والماكروليدات والأمينوغليكوسيدات التي تستخدم عادة في إرشادات علاج NTM ، وتغطي مواقع مقاومة الأدوية جميع مجموعة واحدة من المواقع المتعلقة بمقاومة الأدوية في من فطازات الطفرة المميتة المتفوقة ، بالإضافة إلى جينات مقاومة الأدوية الأخرى المبلغ عنها ومواقع الطفرة وفقًا للتحقيق والإحصاءات الأدب العالي تسجيل في الداخل والخارج.

يعتمد تحديد الكتابة على سلالات NTM الملخصة في إرشادات NTM التي نشرتها المجلة الصينية للسل وأمراض الجهاز التنفسي وإجماع الخبراء. يمكن أن تضخّم الاشعال المصممة للكتابة والتسلسل والتعليق على أكثر من 190 نوعًا من NTM.

من خلال تقنية تضخيم PCR المتعددة المستهدفة ، تم تضخيم جينات التنميط الجيني والجينات المقاومة للعقاقير في الفطريات بواسطة PCR متعدد الإرسال ، وتم الحصول على مزيج من الجينات المستهدفة المراد اكتشافها. يمكن بناء المنتجات المتضخمة في الجيل الثاني أو المكتبات التسلسلية ذات الجيل الثالث من الجيل الثالث ، ويمكن أن تخضع جميع منصات التسلسل من الجيل الثاني من الجيل الثالث لتسلسل تعميق كبير للحصول على معلومات التسلسل للجينات المستهدفة. من خلال مقارنة الطفرات المعروفة الواردة في قاعدة البيانات المرجعية المدمجة (بما في ذلك كتالوج طفرة السل منظمة الصحة العالمية ، تم تحديد الطفرات المتعلقة بمقاومة الأدوية أو حساسية الأدوية المضادة للسل. جنبا إلى جنب مع محلول علاج عينة البلغم الذي تم فتحه ذاتيا من الاختبار الكلي والتجني يتم تطبيقه مباشرة على عينات البلغم السريرية.

نطاق الكشف عن المنتج

34الجينات المتعلقة بمقاومة الأدوية18أدوية مكافحة السل و6تم الكشف عن أدوية NTM ، وتغطية297مواقع مقاومة الأدوية ؛ عشرة أنواع من مرض السل المتفطر وأكثر من190تم اكتشاف أنواع NTM.

الجدول 1: معلومات 18+6 أدوية+190+NTM

ميزة المنتج

القدرة الإكلينيكية القوية: يمكن اكتشاف عينات البلغم مباشرة مع عميل التغذية الذاتي دون ثقافة.

العملية التجريبية بسيطة: الجولة الأولى من عملية التضخيم بسيطة ، ويتم إكمال بناء المكتبة في 3 ساعات ، مما يحسن كفاءة العمل.

الكتابة الشاملة ومقاومة الأدوية: تغطية مواقع الكتابة ومقاومة الأدوية في MTB و NTM ، والتي هي النقاط الرئيسية للقلق السريري ، والكتابة الدقيقة والكشف عن مقاومة الأدوية ، ودعم برامج التحليل المستقل ، وتقارير التحليل بنقرة واحدة.

التوافق: توافق المنتج ، والتكيف مع منصات ILM و MGI/ONT السائدة.

مواصفات المنتج

رمز المنتج	اسم المنتج	منصة الكشف	تحديد
HWTS-NGS-T001	مجموعة طباعة الفطريات وكشف مقاومة الأدوية (طريقة تضخيم مضاعفة)	ont 、 Illumina 、 mgi 、 salus pro	16/96RXN