الحل التشخيصي الرائد لمرض السل والسل المقاوم للأدوية بواسطة #Macro & Micro -Test!

سلاح جديد لتشخيص مرض السل والكشف عن مقاومة الأدوية: جيل جديد من التسلسل المستهدف (tNGS) مع التعلم الآلي لتشخيص فرط الحساسية لمرض السل

تقرير الأدبيات: CCa: نموذج تشخيصي يعتمد على tNGS والتعلم الآلي، وهو مناسب للأشخاص الذين يعانون من مرض السل الجرثومي والتهاب السحايا السلي بشكل أقل.

عنوان الأطروحة: تسلسل الجيل القادم من السل والتعلم الآلي: استراتيجية تشخيصية حساسة للغاية للأنبيبات الرئوية الهادئة والتهاب السحايا الأنبوبي.

دورية: 《Clinica Chimica Acta》

إذا: 6.5

تاريخ النشر: يناير 2024

بالتعاون مع الأكاديمية الصينية للعلوم ومستشفى بكين للصدر التابع لجامعة العاصمة الطبية، أنشأت شركة Macro & Micro-Test نموذجًا لتشخيص مرض السل استنادًا إلى الجيل الجديد من تقنية التسلسل المستهدف (tNGS) وطريقة التعلم الآلي، والتي قدمت نتائج عالية للغاية. حساسية الكشف عن مرض السل مع وجود عدد قليل من البكتيريا والتهاب السحايا السلي، قدمت طريقة جديدة لتشخيص فرط الحساسية للتشخيص السريري لنوعين من مرض السل، وساعدت في التشخيص الدقيق، والكشف عن مقاومة الأدوية وعلاج مرض السل.وفي الوقت نفسه، وجد أنه يمكن استخدام cfDNA في بلازما المريض كنوع عينة مناسب لأخذ العينات السريرية في تشخيص TBM.

في هذه الدراسة، تم استخدام 227 عينة من البلازما وعينات السائل النخاعي لإنشاء مجموعتين سريريتين، حيث تم استخدام عينات الأتراب التشخيصية المختبرية لإنشاء نموذج التعلم الآلي لتشخيص مرض السل، واستخدمت عينات الأتراب التشخيصية السريرية للتحقق من النتائج المؤكدة. نموذج التشخيص.تم استهداف جميع العينات أولاً بواسطة مجموعة مسبار الالتقاط المستهدفة المصممة خصيصًا لمرض السل المتفطرة.بعد ذلك، استنادًا إلى بيانات تسلسل TB-tNGS، يتم استخدام نموذج شجرة القرار لإجراء التحقق المتبادل بخمسة أضعاف على مجموعات التدريب والتحقق من الصحة في قائمة انتظار التشخيص المختبري، ويتم الحصول على عتبات التشخيص لعينات البلازما وعينات السائل النخاعي.يتم إحضار العتبة التي تم الحصول عليها إلى مجموعتين من اختبارات قائمة انتظار التشخيص السريري للكشف عنها، ويتم تقييم الأداء التشخيصي للمتعلم من خلال منحنى ROC.وأخيرا، تم الحصول على نموذج تشخيص مرض السل.

الشكل 1: رسم تخطيطي لتصميم البحث

النتائج: وفقًا للعتبات المحددة لعينة DNA CSF (AUC = 0.974) وعينة cfDNA البلازما (AUC = 0.908) المحددة في هذه الدراسة، من بين 227 عينة، كانت حساسية عينة CSF 97.01٪، وكانت الخصوصية 95.65٪، و وكانت حساسية ونوعية عينة البلازما 82.61% و 86.36%.في تحليل 44 عينة مقترنة من الحمض النووي للبلازما cfDNA والحمض النووي للسائل النخاعي من مرضى TBM، تتمتع الإستراتيجية التشخيصية لهذه الدراسة بثبات عالٍ بنسبة 90.91٪ (40/44) في الحمض النووي للبلازما cfDNA والسائل النخاعي، وتبلغ الحساسية 95.45٪. (42/44).في الأطفال المصابين بالسل الرئوي، تكون الإستراتيجية التشخيصية لهذه الدراسة أكثر حساسية لعينات البلازما من نتائج اكتشاف Xpert لعينات عصير المعدة من نفس المرضى (28.57% مقابل 15.38%).

الشكل 2: أداء تحليل نموذج تشخيص مرض السل للعينات السكانية

الشكل 3: النتائج التشخيصية للعينات المقترنة

الخلاصة: تم إنشاء طريقة تشخيصية شديدة الحساسية لمرض السل في هذه الدراسة، والتي يمكن أن توفر أداة تشخيصية ذات أعلى حساسية للكشف للمرضى السريريين المصابين بالسل قليل العصيات (الثقافة السلبية).قد يكون اكتشاف مرض السل شديد الحساسية استنادًا إلى cfDNA البلازمي نوعًا مناسبًا من العينات لتشخيص مرض السل النشط والتهاب السحايا السلي (جمع عينات البلازما أسهل من جمع السائل النخاعي للمرضى المشتبه في إصابتهم بالسل الدماغي).

الرابط الأصلي: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?عبر٪3Dihub

مقدمة موجزة عن منتجات الكشف عن سلسلة السل من خلال الاختبارات الكلية والجزئية

في ضوء الحالة المعقدة لعينة مرضى السل والاحتياجات المختلفة، يوفر Macro & Micro-Test مجموعة كاملة من حلول NGS لاستخراج التسييل من عينات البلغم، وإنشاء مكتبة Qualcomm وتسلسلها، وتحليل البيانات.وتغطي المنتجات التشخيص السريع لمرضى السل، والكشف عن مقاومة السل للأدوية، وتصنيف المتفطرة السلية والـ NTM، وتشخيص فرط الحساسية لمرض السل السلبي للبكتيريا والمصابين بالسل، وما إلى ذلك.

مجموعات الكشف التسلسلي عن مرض السل والمتفطرات:

رقم الصنف	اسم المنتج	محتوى اختبار المنتج	نوع العينة	نموذج قابل للتطبيق
هوتس-3012	وكيل الافراج عن العينة	تم استخدامه في معالجة تسييل عينات البلغم، وقد حصل على رقم قياسي من الدرجة الأولى، Sutong Machinery Equipment 20230047.	اللعاب
HWTS-NGS-P00021	مجموعة الكشف عن الكمية من كوالكوم لمرض السل شديد الحساسية (طريقة التقاط المسبار)	الكشف عن فرط الحساسية غير الغازية (خزعة سائلة) لمرض السل الرئوي السلبي للبكتيريا وعقيدات الدماغ .تم تحليل عينات الأشخاص المشتبه في إصابتهم بالسل أو المتفطرات غير السلية بواسطة الميتاجينوميات التسلسلية عالية العمق، ومعلومات الكشف عما إذا كانت المتفطرات السلية أو غير السلية مصابة ومعلومات الخط الأول الرئيسية عن مقاومة أدوية المتفطرة السلية تم تزويدنا بها.	الدم المحيطي، سائل الغسيل السنخي، استسقاء الصدر، عينة ثقب التركيز، السائل النخاعي.	الجيل الثاني
هوتس-NGS-T001	مجموعة الكشف عن كتابة المتفطرة ومقاومة الأدوية (طريقة تسلسل التضخيم المتعدد)	اختبار كتابة المتفطرة، بما في ذلك MTBC و187 NTM；يغطي الكشف عن مقاومة بكتيريا المتفطرة السلية للأدوية 13 دواءً و16 موقعًا أساسيًا للطفرات في جينات مقاومة الأدوية.	البلغم، سائل غسل الحويصلات الهوائية، استسقاء الصدر، عينة ثقب التركيز، السائل النخاعي.	منصة مزدوجة من الجيل الثاني/الثالث

أبرز النقاط: HWTS-NGS-T001 مجموعة أدوات الكشف عن مقاومة البكتيريا والبكتيريا للبكتيريا (طريقة التضخيم المتعدد)

مقدمة المنتج

يعتمد المنتج على أدوية الخط الأول والثاني الرئيسية الموصوفة في إرشادات منظمة الصحة العالمية لعلاج السل، والماكروليدات والأمينوغليكوزيدات المستخدمة بشكل شائع في إرشادات علاج NTM، وتغطي مواقع مقاومة الأدوية جميع مجموعة المواقع المرتبطة بمقاومة الأدوية في كتالوج الطفرات المعقدة لمرض السل المتفطرة التابع لمنظمة الصحة العالمية، بالإضافة إلى الجينات المقاومة للأدوية ومواقع الطفرات الأخرى المُبلغ عنها وفقًا للتحقيقات والإحصائيات الخاصة بالأدبيات عالية الدرجات في الداخل والخارج.

يعتمد تحديد النوع على سلالات NTM الملخصة في إرشادات NTM التي نشرتها المجلة الصينية لمرض السل وأمراض الجهاز التنفسي وإجماع الخبراء.يمكن لبادئات الكتابة المصممة تضخيم وتسلسل وتعليق أكثر من 190 نوعًا من أنواع NTM.

من خلال تقنية تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد المستهدف، تم تضخيم جينات التنميط الجيني والجينات المقاومة للأدوية في المتفطرة بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد، وتم الحصول على مجموعة الأمبليكون من الجينات المستهدفة التي سيتم اكتشافها.يمكن بناء المنتجات المضخمة في مكتبات التسلسل عالية الإنتاجية من الجيل الثاني أو الجيل الثالث، ويمكن إخضاع جميع منصات التسلسل من الجيل الثاني والثالث إلى تسلسل عالي العمق للحصول على معلومات التسلسل للجينات المستهدفة.ومن خلال المقارنة مع الطفرات المعروفة الواردة في قاعدة البيانات المرجعية المدمجة (بما في ذلك كتالوج الطفرات المعقدة لبكتيريا المتفطرة السلية لمنظمة الصحة العالمية وعلاقتها بمقاومة الأدوية)، تم تحديد الطفرات المرتبطة بمقاومة الأدوية أو قابلية التأثر بالأدوية المضادة للسل.بالاشتراك مع حل معالجة عينة البلغم المفتوحة ذاتيًا من Macro & Micro-Test، تم حل مشكلة انخفاض كفاءة تضخيم الحمض النووي لعينات البلغم السريرية (أعلى بعشر مرات من الطرق التقليدية)، بحيث يمكن الكشف عن تسلسل مقاومة الأدوية يتم تطبيقه مباشرة على عينات البلغم السريرية.

نطاق الكشف عن المنتج

34الجينات المرتبطة بمقاومة الأدوية18الأدوية المضادة للسل و6تم الكشف عن أدوية NTM، والتي تغطي297مواقع مقاومة الأدوية؛عشرة أنواع من المتفطرة السلية وأكثر من190تم اكتشاف أنواع من NTM.

الجدول 1: معلومات عن أدوية 18+6 +190+NTM

ميزة المنتج

القدرة على التكيف السريري القوي: يمكن اكتشاف عينات البلغم مباشرة باستخدام عامل التسييل الذاتي بدون زراعة.

العملية التجريبية بسيطة: الجولة الأولى من عملية التضخيم بسيطة، ويتم الانتهاء من بناء المكتبة في 3 ساعات، مما يحسن كفاءة العمل.

الكتابة الشاملة ومقاومة الأدوية: تغطية مواقع الكتابة ومقاومة الأدوية في MTB وNTM، وهي النقاط الرئيسية للقلق السريري، والكشف الدقيق عن الكتابة ومقاومة الأدوية، ودعم برامج التحليل المستقلة، وإنشاء تقارير التحليل بنقرة واحدة.

التوافق: توافق المنتج، والتكيف مع منصات ILM وMGI/ONT السائدة.

مواصفات المنتج

كود المنتج	اسم المنتج	منصة الكشف	تحديد
هوتس-NGS-T001	مجموعة الكشف عن كتابة المتفطرة ومقاومة الأدوية (طريقة التضخيم المتعدد)	ONT، إلومينا، MGI، Salus pro	16/96ركسن