حل تشخيصي رائد لمرض السل والسل المقاوم للأدوية بواسطة #Macro & Micro -Test!

سلاح جديد لتشخيص مرض السل واكتشاف مقاومة الأدوية: تسلسل الجيل الجديد المستهدف (tNGS) جنبًا إلى جنب مع التعلم الآلي لتشخيص فرط الحساسية لمرض السل

تقرير أدبي: CCa: نموذج تشخيصي يعتمد على tNGS والتعلم الآلي، وهو مناسب للأشخاص الذين يعانون من مرض السل البكتيري الأقل والتهاب السحايا السلي.

عنوان الرسالة: تسلسل الجيل التالي المستهدف للسل والتعلم الآلي: استراتيجية تشخيصية فائقة الحساسية لالتهاب الأنابيب الرئوية والتهاب السحايا الأنبوبي.

دورية: 《Clinica Chimica Acta》

إذا: 6.5

تاريخ النشر: يناير 2024

بالتعاون مع جامعة الأكاديمية الصينية للعلوم ومستشفى بكين لأمراض الصدر التابع لجامعة العاصمة الطبية، أنشأت شركة ماكرو آند ميكرو-تيست نموذجًا لتشخيص السل يعتمد على الجيل الجديد من تقنية التسلسل المُستهدف (tNGS) وطريقة التعلم الآلي، مما يوفر حساسية فائقة للكشف عن السل ذي البكتيريا القليلة والتهاب السحايا السلي، ويوفر طريقة جديدة لتشخيص فرط الحساسية للتشخيص السريري لنوعين من السل، ويساعد في التشخيص الدقيق والكشف عن مقاومة الأدوية وعلاج السل. في الوقت نفسه، وُجد أن الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (cfDNA) في بلازما المريض يمكن استخدامه كنوع عينة مناسب لأخذ العينات السريرية في تشخيص TBM.

في هذه الدراسة، استُخدمت 227 عينة بلازما وعينات من السائل النخاعي لإنشاء مجموعتين سريريتين، حيث استُخدمت عينات المجموعة التشخيصية المخبرية لإنشاء نموذج التعلم الآلي لتشخيص السل، واستُخدمت عينات المجموعة التشخيصية السريرية للتحقق من نموذج التشخيص المُنشأ. استُهدفت جميع العينات أولاً بواسطة مجموعة مسبار التقاط مُستهدفة مُصممة خصيصًا لبكتيريا السل. بعد ذلك، واستنادًا إلى بيانات تسلسل TB-tNGS، استُخدم نموذج شجرة القرار لإجراء تحقق متبادل خماسي على مجموعات التدريب والتحقق من صحة قائمة انتظار التشخيص المختبري، وتم الحصول على عتبات التشخيص لعينات البلازما وعينات السائل النخاعي. تم إدخال العتبة التي تم الحصول عليها في مجموعتين اختباريتين لقائمة انتظار التشخيص السريري للكشف، وتم تقييم الأداء التشخيصي للمتعلم من خلال منحنى ROC. وأخيرًا، تم الحصول على نموذج تشخيص السل.

الشكل 1 مخطط تخطيطي لتصميم البحث

النتائج: وفقًا للعتبات المحددة لعينة الحمض النووي في السائل الدماغي الشوكي (AUC = 0.974) وعينة الحمض النووي الخالي من الصفائح الدموية في البلازما (AUC = 0.908) المُحددة في هذه الدراسة، بلغت حساسية عينة السائل الدماغي الشوكي 97.01%، وخصوصيتها 95.65%، وحساسية ونوعية عينة البلازما 82.61% و86.36% على التوالي. في تحليل 44 عينة مقترنة من الحمض النووي الخالي من الصفائح الدموية في البلازما والحمض النووي للسائل الدماغي الشوكي من مرضى TBM، اتسمت استراتيجية التشخيص في هذه الدراسة بثبات عالٍ بلغ 90.91% (40/44) في الحمض النووي الخالي من الصفائح الدموية في البلازما والحمض النووي للسائل الدماغي الشوكي، وبلغت الحساسية 95.45% (42/44). عند الأطفال المصابين بالسل الرئوي، كانت استراتيجية التشخيص في هذه الدراسة أكثر حساسية لعينات البلازما من نتائج كشف Xpert لعينات عصير المعدة من نفس المرضى (28.57٪ مقابل 15.38٪).

الشكل 2 أداء تحليل نموذج تشخيص السل لعينات السكان

الشكل 3 نتائج التشخيص للعينات المقترنة

الاستنتاج: في هذه الدراسة، وُضعت طريقة تشخيصية فائقة الحساسية لمرض السل، تُوفر أداة تشخيصية تتميز بأعلى حساسية للكشف لدى المرضى السريريين المصابين بالسل قليل العصيات (الزرع السلبي). قد يكون الكشف عن السل شديد الحساسية باستخدام الحمض النووي الخالي من الخلايا في البلازما (cfDNA) نوعًا مناسبًا من العينات لتشخيص السل النشط والتهاب السحايا السلي (جمع عينات البلازما أسهل من جمع السائل النخاعي لدى المرضى المشتبه بإصابتهم بسل الدماغ).

الرابط الأصلي: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub

مقدمة موجزة عن منتجات الكشف عن مرض السل من سلسلة Macro & Micro-Test

نظراً لتعقيد حالة عينات مرضى السل واحتياجاتهم المتنوعة، توفر شركة ماكرو آند ميكرو-تيست مجموعة متكاملة من حلول الجيل التالي من الجينوم (NGS) لاستخراج السائل من عينات البلغم، وبناء مكتبة كوالكوم وتسلسلها، وتحليل البيانات. تشمل هذه المنتجات التشخيص السريع لمرضى السل، والكشف عن مقاومة السل للأدوية، وتحديد نوع المتفطرة السلية والسل غير النمطي (NTM)، وتشخيص فرط الحساسية لمرضى السل السلبي للبكتيريا والمصابين بالسل، وغيرها.

مجموعات الكشف التسلسلي عن مرض السل والبكتيريا:

رقم الصنف	اسم المنتج	محتوى اختبار المنتج	نوع العينة	النموذج المطبق
HWTS-3012	عامل تحرير العينة	يستخدم في معالجة تسييل عينات البلغم، وقد حصل على رقم قياسي من الدرجة الأولى، Sutong Machinery Equipment 20230047.	البلغم
HWTS-NGS-P00021	مجموعة كوالكوم للكشف عن الكمية لمرض السل شديد الحساسية (طريقة التقاط المسبار)	الكشف عن فرط الحساسية غير الجراحي (خزعة السائل) لمرض السل الرئوي السلبي للبكتيريا وعقيدات الدماغ؛ تم تحليل عينات الأشخاص المشتبه في إصابتهم بالسل أو المتفطرات غير السلية من خلال ميتاجينوميات التسلسل عالية العمق، وتم توفير معلومات الكشف عما إذا كانت المتفطرات السلية أو غير السلية مصابة بالعدوى ومعلومات مقاومة الأدوية الرئيسية من الخط الأول لمتفطرات السل.	الدم المحيطي، سائل غسيل الحويصلات الهوائية، استسقاء الصدر والاستسقاء، عينة البزل البؤري، السائل النخاعي.	الجيل الثاني
HWTS-NGS-T001	مجموعة تحديد نوع المتفطرة ومقاومة الأدوية (طريقة تسلسل التضخيم المتعدد)	اختبار تحديد نوع المتفطرة، بما في ذلك MTBC و187 NTM；يغطي الكشف عن مقاومة الأدوية لبكتيريا السل 13 دواءً و16 موقعًا أساسيًا للطفرة في جينات مقاومة الأدوية.	البلغم، سائل غسيل الحويصلات الهوائية، استسقاء الصدر والاستسقاء، عينة البزل البؤري، السائل النخاعي.	منصة مزدوجة من الجيل الثاني/الثالث

أبرز الميزات: مجموعة HWTS-NGS-T001 لتشخيص نوع المتفطرة ومقاومة الأدوية (بطريقة التضخيم المتعدد)

مقدمة المنتج

يعتمد المنتج على الأدوية الرئيسية من الخط الأول والثاني الموضحة في إرشادات منظمة الصحة العالمية لعلاج السل، والماكروليدات والأمينوغليكوزيدات المستخدمة بشكل شائع في إرشادات علاج NTM، وتغطي مواقع مقاومة الأدوية جميع مجموعات المواقع المرتبطة بمقاومة الأدوية في كتالوج الطفرات المعقدة لمتفطرات السل لمنظمة الصحة العالمية، بالإضافة إلى جينات مقاومة الأدوية الأخرى ومواقع الطفرات المبلغ عنها وفقًا للتحقيقات والإحصائيات الصادرة عن الأدبيات ذات الدرجات العالية في الداخل والخارج.

يعتمد تحديد النمط على سلالات NTM الموجزة في إرشادات NTM التي نشرتها المجلة الصينية للسل وأمراض الجهاز التنفسي، وإجماع الخبراء. تستطيع بادئات النمط المُصممة تضخيم أكثر من 190 نوعًا من NTM وتسلسلها وشرحها.

باستخدام تقنية تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد المُستهدف، تم تضخيم جينات التنميط الجيني والجينات المقاومة للأدوية لبكتيريا المتفطرة، وتم الحصول على التركيبة المُضخّمة للجينات المستهدفة المراد اكتشافها. يمكن بناء النواتج المُضخّمة في مكتبات تسلسل عالية الإنتاجية من الجيل الثاني أو الثالث، ويمكن إخضاع جميع منصات التسلسل من الجيلين الثاني والثالث لتسلسل عالي العمق للحصول على معلومات تسلسل الجينات المستهدفة. بمقارنتها بالطفرات المعروفة الموجودة في قاعدة البيانات المرجعية المُدمجة (بما في ذلك كتالوج طفرات مُعقد المتفطرة السلية التابع لمنظمة الصحة العالمية وعلاقته بمقاومة الأدوية)، تم تحديد الطفرات المرتبطة بمقاومة الأدوية أو حساسية أدوية السل. باستخدام محلول معالجة عينة البلغم ذاتية الفتح من Macro & Micro-Test، تم حل مشكلة انخفاض كفاءة تضخيم الأحماض النووية لعينات البلغم السريرية (أعلى بعشر مرات من الطرق التقليدية)، بحيث يمكن تطبيق اكتشاف تسلسل مقاومة الأدوية مباشرة على عينات البلغم السريرية.

نطاق اكتشاف المنتج

34الجينات المرتبطة بمقاومة الأدوية18الأدوية المضادة للسل و6تم اكتشاف أدوية NTM، تغطي297مواقع مقاومة الأدوية؛ عشرة أنواع من المتفطرة السلية وأكثر من190تم الكشف عن أنواع من NTM.

الجدول 1: معلومات عن 18+6 أدوية +190+NTM

ميزة المنتج

قدرة قوية على التكيف السريري: يمكن الكشف عن عينات البلغم مباشرة باستخدام عامل التسييل الذاتي دون الحاجة إلى زراعة.

العملية التجريبية بسيطة: الجولة الأولى من عملية التضخيم بسيطة، ويتم الانتهاء من بناء المكتبة في 3 ساعات، مما يحسن كفاءة العمل.

الكتابة الشاملة ومقاومة الأدوية: تغطية مواقع الكتابة ومقاومة الأدوية لـ MTB و NTM، وهي النقاط الرئيسية للقلق السريري، والكشف الدقيق عن مقاومة الأدوية، ودعم برامج التحليل المستقلة، وإنشاء تقارير التحليل بنقرة واحدة.

التوافق: توافق المنتج، والتكيف مع منصات ILM وMGI/ONT السائدة.

مواصفات المنتج

رمز المنتج	اسم المنتج	منصة الكشف	تحديد
HWTS-NGS-T001	مجموعة تحديد نوع المتفطرة ومقاومة الأدوية (طريقة التضخيم المتعدد)	ONT، إلومينا، MGI، Salus pro	16/96rxn